ADAT

With the advancement of sequencing technologies and bioinformatics, over than 170 different RNA modifications have been identified. However, only a few of these modifications can lead to base pair changes, which are called RNA editing. RNA editing is a ubiquitous modification in mammalian transcriptomes and is an important co/posttranscriptional modification that plays a crucial role in various cellular processes. There are two main types of RNA editing events: adenosine to inosine (A-to-I) editing, catalyzed by ADARs on double-stranded RNA or ADATs on tRNA, and cytosine to uridine (C-to-U) editing catalyzed by APOBECs...

A-to-I RNA editing catalyzed by adenosine-deaminase-acting-on-RNA (ADARs) was assumed to be unique to metazoans because fungi and plants lack ADAR homologs. However, genome-wide messenger RNA (mRNA) editing was found to occur specifically during sexual reproduction in filamentous ascomycetes. Because systematic characterization of adenosine/cytosine deaminase genes has implicated the involvement of TAD2 and TAD3 orthologs in A-to-I editing, in this study, we used genetic and biochemical approaches to characterize the role of FgTAD2 , an essential adenosine-deaminase-acting-on-tRNA (ADAT) gene, in mRNA editing in Fusarium graminearum ...

Uncontrolled cell proliferation is a common definition of cancer. After lung carcinoma, breast neoplasm is the second-most prevalent kind of cancer. The majority of breast cancer cells and healthy breast cells both have receptors for circulating oestrogen and progesterone. In order to promote the development and division of cancer cells, oestrogen and progesterone bind to the receptors and may collaborate with growth factors (such as oncogenes and mutant tumour suppressor genes). As per the literature, Tecteria coadunata (Wall...

BACKGROUND: During the last two decades, several reports have indicated an increase in the number of type-2 diabetes among adolescents. Therefore, an assessment of adolescents' awareness of this disease deserves serious consideration. This study aims at designing a psychometric tool for assessing adolescents' awareness of type-2 diabetes. METHODS AND MATERIAL: In this methodological research, 770 students attending 10 middle schools (five girls "schools and five boys" schools) from Tehran participated in the study...

Globally, 2.3 million women were diagnosed with breast cancer, with 6,85000 mortalities in year 2021; making it the world's most prevalent cancer. This growing global burden necessitates a new treatment option, and plant-based medicines offers a promising alternative to conventional cancer treatment. In this work, screening of phytoconstituents of an indigenous therapeutic plant, Bauhinia variegata carried out for potential regulator of tumor suppressor protein p53. Here, an in-silico analysis was employed to develop more effective, pharmaceutically potent small drug-like compounds that target tumor suppressor protein p53...

The conversion of adenosine to inosine at the wobble position of select tRNAs is essential for decoding specific codons in bacteria and eukarya. In eukarya, wobble inosine modification is catalyzed by the heterodimeric ADAT complex containing ADAT2 and ADAT3. Human individuals homozygous for loss of function variants in ADAT3 exhibit intellectual disability disorders. We created a flexible computational tool to scan the human, mouse, nematode, fruit fly, and yeast exomes for genes either enriched or depleted in ADAT-dependent codons as compared to background models of codon bias derived from the exomes themselves...

Dysfunctional autophagy is associated with various human diseases, e.g., cancer. The discovery of small molecules modulating autophagy with therapeutic potential could be significant. To this end, we screened the ability of a series of metabolites isolated from marine microorganisms to modulate autophagy. Anhydrodebromoaplysiatoxin (ADAT), a metabolite yielded by the marine red algae Gracilaria coronopifolia , inhibited autophagosome-lysosome fusion in mammalian cells, thereby inducing the accumulation of autophagosomes...

Screen time is associated with several health risk behaviors including mindless eating, sedentary behavior, and decreased academic performance. Screen time behavior is traditionally assessed with self-report measures, which are known to be burdensome, inaccurate, and imprecise. Recent methods to automatically detect screen time are geared more towards detecting television screens from wearable cameras that record high-resolution video. Activity-oriented wearable cameras (i.e., cameras oriented towards the wearer with a fisheye lens) have recently been designed and shown to reduce privacy concerns, yet pose a greater challenge in capturing screens due to their orientation and fewer pixels on target...

Oxidative stress represents one of the principal causes of inherited retinal dystrophies, with many related molecular mechanisms still unknown. We investigated the posttranscriptional RNA editing landscape of human retinal pigment epithelium cells (RPE) exposed to the oxidant agent N-retinylidene-N-retinyl ethanolamine (A2E) for 1 h, 2 h, 3 h and 6 h. Using a transcriptomic approach, refined with a specific multialgorithm pipeline, 62,880 already annotated and de novo RNA editing sites within about 3000 genes were identified among all samples...

This study aimed to understand Indonesian healthcare professionals' (HCPs) perceptions and experiences regarding barriers to both HCP and community adherence to COVID-19 prevention guidelines in their social life. This methodologically qualitative study employed in-depth interviewing as its method for primary data collection. Twenty-three HCP participants were recruited using the snowball sampling technique. Data analysis was guided by the Five Steps of Qualitative Data Analysis introduced through Ritchie and Spencer's Framework Analysis...

Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 was originally identified in Wuhan city of China in December 2019 and it spread rapidly throughout the globe, causing a threat to human life. Since targeted therapies are deficient, scientists all over the world have an opportunity to develop novel drug therapies to combat COVID-19. After the declaration of a global medical emergency, it was established that the Food and Drug Administration (FDA) could permit the use of emergency testing, treatments, and vaccines to decrease suffering, and loss of life, and restore the nation's health and security...

Car crashes are among the top ten leading causes of death; they could mainly be attributed to distracted drivers. An advanced driver-assistance technique (ADAT) is a procedure that can notify the driver about a dangerous scenario, reduce traffic crashes, and improve road safety. The main contribution of this work involved utilizing the driver's attention to build an efficient ADAT. To obtain this "attention value", the gaze tracking method is proposed. The gaze direction of the driver is critical toward understanding/discerning fatal distractions, pertaining to when it is obligatory to notify the driver about the risks on the road...

Összefoglaló. Bevezetés: A diabetes mellitus és a különböző szájüregi elváltozások szoros kapcsolatát számos irodalmi adat bizonyítja. Munkacsoportunk az elsők között tárta fel az oralis malignus daganatok és a cukorbetegség epidemiológiai összefüggéseit. A nemzetközi szakirodalomban már megjelentek olyan publikációk, amelyek a cukorháztartás és a gyógyszer okozta állcsontnekrózis közötti kapcsolatot vizsgálták. Célkitűzés: Jelen tanulmányunkban arra a kérdésre kerestük a választ, hogy a hazai populációban a biszfoszfonát okozta állcsontnekrózisban szenvedő betegek körében milyen gyakorisággal fordul elő diagnosztizált cukorbetegség és emelkedett éhomi vércukor...

Összefoglaló. Kilenc magyarországi orvostársaság közös ajánlást alakított ki a D-vitamin javasolt normáltartományával, a D-vitamin-pótlás adagjával és az adagolás módjával kapcsolatban. Összefoglalták azokat a klinikai állapotokat, betegségeket, amelyek kialakulása összefüggésben lehet a D-vitamin-hiánnyal. Magyarországon a D-vitamin-hiány - főleg a tél végére - rendkívül gyakori. A javasolt normáltartomány alsó határa 75 nmol/l, annak ellenére, hogy a hiány klinikai jelentősége főleg 50 nmol/l alatti értékeknél nyilvánvaló, ám mivel a D-vitamin pótlása a javasolt dózisban biztonságos, mindenkinél érdemes csökkenteni a D-vitamin-hiánnyal kapcsolatos egészségügyi kockázatot...

Összefoglaló. Bevezetés: A szakirodalomban számos felmérés született az újszülöttkori bőrelváltozások előfordulási gyakoriságának vizsgálatára. Az epidemiológiai vizsgálatok eredményei azonban nem mindig adaptálhatók, hiszen jelentős különbségeket találunk az egyes népcsoportok bőrmanifesztációi között, emellett kevés és ellentmondásos adat áll rendelkezésre arról, hogy milyen tényezők befolyásolják ezen bőrtünetek kialakulását. Célkitűzés: Prospektív kohorszvizsgálatunk fő célkitűzése az volt, hogy felmérjük az alapvetően egészséges, érett újszülöttek bőrgyógyászati elváltozásainak előfordulási gyakoriságát, illetve megvizsgáljuk az ezen elváltozások kialakulásában szerepet játszó tényezőket...

Adenosine-to-inosine conversion at position 34 (A34-to-I) of certain tRNAs is essential for expanding their decoding capacity. This reaction is catalyzed by the adenosine deaminase acting on tRNA (ADAT) complex, which in Eukarya is formed by two subunits: ADAT2 and ADAT3. We herein identified and thoroughly characterized the ADAT molecules from the protozoan pathogen Trypanosoma cruzi, the causative agent of Chagas Disease. TcADAT2 and TcADAT3 spontaneously form a catalytically active complex, as shown by expression in engineered bacteria and/or by the increased ex vivo tRNA A-to-I deamination activity of T...

Összefoglaló. A malignus daganatok és a stroke együttesen gyakran fordulnak elő a stroke tradicionális rizikófaktoraival (magas vérnyomás, hyperlipidaemia, cukorbetegség, elhízás, dohányzás) rendelkező betegekben. Az elmúlt évtized kutatási eredményei alátámasztották, hogy a rosszindulatú daganatban szenvedő betegekben szignifikánsan nagyobb a stroke kockázata. A malignus daganatokhoz társuló stroke a leggyakrabban a malignus daganat diagnózisát követő fél-egy év során jelentkezik...

Összefoglaló. A dohányzás jelenleg is az egyik legjelentősebb népegészségügyi probléma hazánkban. Az orvosi szakterületek többségében előkerül a dohányzásleszokás-támogatás kérdése. Ezért az orvostársadalom számára az aktuális gyógyszeres terápiás ismeretek összefoglalása hasznos lehet. A jelen közleményben a leszokástámogatás elsődlegesen választandó gyógyszeres terápiáját tekintjük át a legújabb összefoglalók és irányelvek szerint. A gyógyszeres lehetőségek közül jelenleg a vareniklin és a nikotinpótló terápia választandó elsőként, nemcsak a leszokás, hanem az ártalomcsökkentés tekintetében is...

Összefoglaló. A primer Sjögren-szindróma (pSS) krónikus autoimmun betegség, melynek elsődleges tünetei az exokrin mirigyeket érintő autoimmun folyamat következtében létrejövő szem- és szájszárazság, szisztémás manifesztációi között pedig a leggyakoribbak a szellemi és fizikai fáradtság és az ízületi fájdalmak. A betegség lélektani vonatkozásait nagy érdeklődés övezi; közleményünk a vonatkozó kutatási eredményeket foglalja össze a hátterükben húzódó pszichoneuroimmunmodulációs háttér rövid bemutatásával...

We use the adaptive resolution simulation (AdResS) technique to estimate the region in space where water-mediated effects in molecule-molecule interactions are relevant. AdResS is employed to identify the region around the solute (solvation shell) where the atomistic details of the hydrogen bonding network are relevant while outside water plays the role of a thermodynamic bath that can be described at simplified macroscopic level. The consequence is that for the interaction of two solutes the intermolecular distance at which water mediated effects start to be relevant is represented by the sum of the radii of the two respective solvation shells identified via AdResS...